Das neue Modul des „Apfelmikrobiom“ Projektes hat diese Woche gestartet!
Die Schülerinnen der 6ten Klasse des Akademischen Gymnasiums Graz, Josefine und Fiona, werden während diesem Semester nach nachhaltigen und ökologisch sinnvollen Methoden suchen um die „Lagerfäule“ am Apfel zu bekämpfen. Die Krankheit wird von dem Schadpilz Gloeosporium verursacht und kommt während der Lagerung der Äpfel zum Ausbruch. Dadurch entstehen große Verluste, vor allem in der biologischen Apfelwirtschaft. Josefine und Fiona suchen gemeinsam mit Wissenschaftlern der TU Graz Mikroorganismen, die eine hemmende Wirkung gegen Gloeosporium besitzen und helfen bei der Entwicklung eines sogenannten Biokontroll-Produktes, das bei der Einlagerung der Äpfel im Herbst zum Einsatz kommt.
Die Schülerinnen aus der Modellschule Graz haben heute einen Einblick in das Leben des Molekularbiologen bekommen! Sie haben Bakterien aus einem Apfel isoliert und für die nachfolgende DNA-Sequenzierung (die Bestimmung der Nukleotid-Abfolge in einem DNA-Molekül) vorbereitet. Bis jetzt haben wir nur mit kultivierbaren Bakterien und Pilzen – d.h. mit solchen die auf einer Agarplatte wachsen – gearbeitet. Dies sind aber weniger als 1% der gesamten Bakterien die sich kultivieren lassen!
Um die restlichen Bewohner des Apfels zu identifizieren und ihre Rolle für die Gesundheit des Menschen zu studieren, muss man die DNA aus den Bakterien isolieren und bestimmte DNA Abschnitte vervielfältigen; das wird durch Polymerase-Kettenreaktion („PCR“) erreicht. So lässt sich bestimmen, um welche Mikroorganismenart es sich handelt. Die isolierten DNA Abschnitte werden aufgereinigt und zu einer Sequenzierungsfirma geschickt. Um die Qualität der PCRs zu prüfen, werden die DNA Stücke auf ein Agarosegel aufgetragen und unter UV-Licht untersucht.
Heute war für die Schülerinnen der Modellschule Graz einer der spannendsten Tage im Labor. Sie durften die Mikroorganismen, welche im und auf dem Apfel leben mikroskopieren, und zwar mit einem „Konfokal Laserscan Mikroskop“, das es ermöglicht, die Pflanzenstrukturen in 3D zu betrachten und die genaueren Muster zu untersuchen, welche die Bakterienkolonien und Pilzhyphen im Pflanzengewebe bilden.
Besuch einer Obstgartenanlage in biologischer Landwirtschaft.
Birgit Birnstingl zeigte Beispiele erkrankter Äpfel und erzählte über biologische Landwirtschaft.
