In diesem Blog werden einige Schritte festgehalten , die im Labor und im Kunstunterricht gemacht wurden.
Die Schülerinnen aus der Modellschule Graz haben heute einen Einblick in das Leben des Molekularbiologen bekommen! Sie haben Bakterien aus einem Apfel isoliert und für die nachfolgende DNA-Sequenzierung (die Bestimmung der Nukleotid-Abfolge in einem DNA-Molekül) vorbereitet. Bis jetzt haben wir nur mit kultivierbaren Bakterien und Pilzen – d.h. mit solchen die auf einer Agarplatte wachsen – gearbeitet. Dies sind aber weniger als 1% der gesamten Bakterien die sich kultivieren lassen!
Um die restlichen Bewohner des Apfels zu identifizieren und ihre Rolle für die Gesundheit des Menschen zu studieren, muss man die DNA aus den Bakterien isolieren und bestimmte DNA Abschnitte vervielfältigen; das wird durch Polymerase-Kettenreaktion („PCR“) erreicht. So lässt sich bestimmen, um welche Mikroorganismenart es sich handelt. Die isolierten DNA Abschnitte werden aufgereinigt und zu einer Sequenzierungsfirma geschickt. Um die Qualität der PCRs zu prüfen, werden die DNA Stücke auf ein Agarosegel aufgetragen und unter UV-Licht untersucht.
Heute war für die Schülerinnen der Modellschule Graz einer der spannendsten Tage im Labor. Sie durften die Mikroorganismen, welche im und auf dem Apfel leben mikroskopieren, und zwar mit einem „Konfokal Laserscan Mikroskop“, das es ermöglicht, die Pflanzenstrukturen in 3D zu betrachten und die genaueren Muster zu untersuchen, welche die Bakterienkolonien und Pilzhyphen im Pflanzengewebe bilden.
Unser Poster hat am 2. Februar bei der Sparkling/Citizen Science Konferenz einen Preis gewonnen!
Wir haben viele wertvolle Kontakte geknüpft und einiges über Austauschmöglichkeiten und die Zusammenarbeit von Wissenschaft und Schule gelernt. Unser jüngstes Team-Mitglied Maya (fast 3 Monate alt) hat alles ganz brav mitgemacht 😊.
Die entstandenen Bakterienkolonien auf den Agarplatten wurden gezählt und unter sterilen Bedingungen einzeln auf neue Agarplatten aufgetragen.
Aufteilung der Mikrohabitate der Äpfel zur genauen Bestimmung der Lokalität unserer Bakterienisolate.
Agarplatten gießen, beschriften & sonstige Vorbereitungen für die Probenaufarbeitung.